聚光镜一般采用弱激励长焦距方式数码显微镜其放大倍数M"=1-2X。这样显微镜的像距较长，可以满足上述结构布局的要求。在使用中徕卡显微镜总是先选定聚光镜的工作档，相当于电镜面板上标出的束斑'1"、 w2n、 Man， "4”等.然后根据需要调节第二聚光镜的激励电流，以改变落显微镜在样品面上的束斑聚焦情况，包括r,, a,和J‘取不同的值。从欠焦，正焦--s过焦，r的值将从大~小一大，数码值久则从小一大、小。根据显微镜亮度不变原理得知，J,的值相应为从小~大~小。由此可见r,和J。的变化趋势正好符合正常的要求，问题在于a.故然在一般性实验中可允许采用数码显微镜照明孔径角条件，但在高分辨工作和电子衍射实验中往往需要有高相干性(方向性)光源。为此在第二显微镜处插入一块可动偏光板，板上有几个孔径不IM的光阑片，如205m, 505m, 1005m, 2005m等。根据不同要求可选用不同孔径的光阑，同时适当照顾足够的光强度。必须指出，当显微镜用于小束斑档时，因束张角过大，必有相当数量的电子被第二聚光镜光阑所拦截，因此显微镜参与成像的电子数减少，光强减弱。

在照明系统中还有为了帮助电子束偏光显微镜用的偏转线圈，包括电子枪偏转器和聚光镜偏转器，可以用来校正显微镜电子束在合轴方面的缺陷(包括平移和倾斜)。一种称为消像散器的部件将产生有一定椭圆度的磁场分布，刚好可用来抵消显微镜原系统中的非轴对称性。每个聚光镜都还有相应的固定喷嘴光阑，目的是挡去显微镜杂散电子减小噪声。至于第二聚光镜可动偏光显微镜光阑板的作用，前面己经提及。

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