于彩色显微镜摄影的中性密度滤光片有0.30, 0.60和0.90三种密度，如上表所示，其透射率分别为50%, 25%和12.5%。由于密度为0.30的滤光片具有50%的透射率，它降低亮度的曝光系数为2，密度为。.60的滤光片具有25%的透射率，尼康显微镜降低亮度的曝光系数为4。故这些中性密度滤光片可以单独使用，也可以组合使用，组合使用时总密度等于各个滤光片的密度之和。

在彩色显微照相中造成色彩不平衡的原因，除了在曝光和冲洗过程中的失误，在光路中遗留下反差滤片以及不正确地使用光源等等以外，奥林巴斯显微镜还存在着以下几个重要因素:①内装在一些照明器中的吸热滤片显微镜可以吸收大量的红光;②对于彩色胶片非常敏感的紫外幅射的影响③用加拿大树胶封藏的旧切片可以显示出很亮的黄色，而对于人的眼睛来说常常是不易察觉的;以上三种因素都可以使用彩色补偿滤光片进行校正。另外，④当胶片存放在具有射线的房间内时受到X一射线、丫一射线的幅射曝光，这一点必须尽量设法避免。

现在彩色显微照相的曝光大多数是在反转片上进行的，反转片在显影之后可以直接产生一个透明的正片，而可以被洗印成一般照片的底片即彩色负片却很少使用。这主要不是经济上的原因，而是因为彩色照片的洗印技术过于复杂，数码显微镜对于一般的实验室来说要得到色彩调和的洗印片是比较困难的，而反转片的冲洗就比较容易，另外，彩色反转片更适合于教学或学术交流中的幻灯演示。