显微镜技术沿着两个方向发展的。一是显微镜的结构与种类，另一是生物标本的染色技术。

光学显微镜由原初的传统生物显微镜演变出诸多种类的专用显微镜及其应用技术如相差显微镜、暗视野显微镜、荧光显微镜、偏振光显微镜、干涉显微镜、缝隙显微镜、紫外光显微镜、奥林巴斯显微镜、倒置显微镜、落射光显微镜、显微分光光度计、显微操纵仪以及熔点显微镜、矿石显微镜、、立体显微镜以及声学显微镜等等.与此同时，世界各国的大厂家将各自的专用显微镜形成系列化产品，将其主机的规格定型化.为这类主机制作各类专用部件.也就是说，同一个主机上配备某一套专用部件就将成为专用显微镜。

拆下这些专用部件而改换另一套专用部件时又变成另一种专用显微镜。由此必然出现一种显微镜结构向集成化和积木化(用形像语言说的叠罗汉式)发展的趋势.这种趋势的最典型例子是Opton公司的Axiomat I DC。这种显微镜就像儿童玩具积木相似。改变堆积方式可以改变其用途。其他显微镜公司的大型显微镜也沿此趋势在发展。在主机上堆积各种照像装置、录相装置、电子装置和分光装置发挥更为广泛的作用和用途。这称集成化趋势。

现代显微镜技术除了几种生活细胞的观察技术如相差技术、紫外光干涉技术、偏振光技术、暗视野技术之外，更多的显微镜技术是依靠染色技术观察生物细胞的各种生物化学成分。

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